EBI BioSamples
БесплатноНе проверенBiological sample metadata and provenance from the EMBL-EBI BioSamples archive.
Описание
Biological sample metadata and provenance from the EMBL-EBI BioSamples archive.
README
EBI BioSamples MCP.
Part of Pipeworx — an MCP gateway connecting AI agents to 1394+ live data sources.
Tools
| Tool | Description |
|---|---|
search_samples |
Search EBI BioSamples — metadata for biological samples (cell lines, tissues, organisms) referenced across EBI archives. Free-text search by organism, tissue, or keyword; returns matching samples with accession, name, organism, and release date. Keyless. |
get_sample |
Fetch a single EBI BioSamples record by accession. Returns the sample name, dates, taxId, organism, and a flattened map of its characteristics (organism, tissue, sex, cell type, etc.). Keyless. |
Quick Start
Add to your MCP client (Claude Desktop, Cursor, Windsurf, etc.):
{
"mcpServers": {
"biosamples": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/biosamples/mcp"
}
}
}
Or connect to the full Pipeworx gateway for access to all 1394+ data sources:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
Using with ask_pipeworx
Instead of calling tools directly, you can ask questions in plain English:
ask_pipeworx({ question: "your question about Biosamples data" })
The gateway picks the right tool and fills the arguments automatically.
More
License
MIT
Установить EBI BioSamples в Claude Desktop, Claude Code, Cursor
unyly install ebi-biosamplesСтавит в Claude Desktop, Claude Code, Cursor и VS Code — сам разбирается с npx, uvx и сборкой из исходников.
Впервые? Поставь CLI: curl -fsSL https://unyly.org/install | sh
Или настроить вручную
Выполни в терминале:
claude mcp add ebi-biosamples -- npx -y @pipeworx/mcp-biosamplesПошаговые гайды: как установить EBI BioSamples
FAQ
EBI BioSamples MCP бесплатный?
Да, EBI BioSamples MCP бесплатный — установка в пару кликов через Unyly без оплаты.
Нужен ли API-ключ для EBI BioSamples?
Нет, EBI BioSamples работает без API-ключей и переменных окружения.
EBI BioSamples — hosted или self-hosted?
Self-hosted: сервер запускается локально на твоей машине командой из раздела установки.
Как установить EBI BioSamples в Claude Desktop, Claude Code или Cursor?
Открой EBI BioSamples на unyly.org, выбери вкладку своего клиента (Claude Desktop, Claude Code, Cursor) и нажми Install — конфиг сгенерируется автоматически, без правки JSON.
Похожие MCP
GitHub
PRs, issues, code search, CI status
автор: GitHubFilesystem
Secure file operations with configurable access controls.
Memory
Knowledge graph-based persistent memory system.
Template MCP Server
A CLI tool to create a new Model Context Protocol server project with TypeScript support, dual transport options, and an extensible structure
автор: mcpdotdirectCompare EBI BioSamples with
Не уверен что выбрать?
Найди свой стек за 60 секунд
Автор?
Embed-бейдж для README
Похожее
Все в категории development