EBI BioStudies
БесплатноНе проверенBiological studies metadata and cross-database links from the EMBL-EBI BioStudies repository.
Описание
Biological studies metadata and cross-database links from the EMBL-EBI BioStudies repository.
README
EBI BioStudies MCP.
Part of Pipeworx — an MCP gateway connecting AI agents to 1394+ live data sources.
Tools
| Tool | Description |
|---|---|
search_studies |
Search EBI BioStudies — a keyless database of biological study descriptions that links across EBI archives (ArrayExpress, PRIDE, etc.). Find studies by keyword and get accession, title, authors, type, release date, and link/file counts. |
get_study |
Get the metadata for a single EBI BioStudies study by accession (e.g. "S-EPMC6010251"). Returns the title, flattened attributes (abstract, release date, data source, etc.), and counts of links and subsections. EBI BioStudies links across EBI archives. Keyless. |
Quick Start
Add to your MCP client (Claude Desktop, Cursor, Windsurf, etc.):
{
"mcpServers": {
"biostudies": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/biostudies/mcp"
}
}
}
Or connect to the full Pipeworx gateway for access to all 1394+ data sources:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
Using with ask_pipeworx
Instead of calling tools directly, you can ask questions in plain English:
ask_pipeworx({ question: "your question about Biostudies data" })
The gateway picks the right tool and fills the arguments automatically.
More
License
MIT
Установить EBI BioStudies в Claude Desktop, Claude Code, Cursor
unyly install ebi-biostudiesСтавит в Claude Desktop, Claude Code, Cursor и VS Code — сам разбирается с npx, uvx и сборкой из исходников.
Впервые? Поставь CLI: curl -fsSL https://unyly.org/install | sh
Или настроить вручную
Выполни в терминале:
claude mcp add ebi-biostudies -- npx -y @pipeworx/mcp-biostudiesПошаговые гайды: как установить EBI BioStudies
FAQ
EBI BioStudies MCP бесплатный?
Да, EBI BioStudies MCP бесплатный — установка в пару кликов через Unyly без оплаты.
Нужен ли API-ключ для EBI BioStudies?
Нет, EBI BioStudies работает без API-ключей и переменных окружения.
EBI BioStudies — hosted или self-hosted?
Self-hosted: сервер запускается локально на твоей машине командой из раздела установки.
Как установить EBI BioStudies в Claude Desktop, Claude Code или Cursor?
Открой EBI BioStudies на unyly.org, выбери вкладку своего клиента (Claude Desktop, Claude Code, Cursor) и нажми Install — конфиг сгенерируется автоматически, без правки JSON.
Похожие MCP
wenb1n-dev/SmartDB_MCP
A universal database MCP server supporting simultaneous connections to multiple databases. It provides tools for database operations, health analysis, SQL optim
автор: wenb1n-devPostgres Server
This server enables interaction with PostgreSQL databases through the Model Context Protocol, optimized for the AWS Bedrock AgentCore Runtime. It provides tools
автор: madhurprashPostgres
Query your database in natural language
автор: AnthropicPostgreSQL
Read-only database access with schema inspection.
автор: modelcontextprotocolCompare EBI BioStudies with
Не уверен что выбрать?
Найди свой стек за 60 секунд
Автор?
Embed-бейдж для README
Похожее
Все в категории data
