Command Palette

Search for a command to run...

UnylyUnyly
Весь каталог

EBI BioStudies

БесплатноНе проверен

Biological studies metadata and cross-database links from the EMBL-EBI BioStudies repository.

GitHubEmbed

Описание

Biological studies metadata and cross-database links from the EMBL-EBI BioStudies repository.

README

EBI BioStudies MCP.

Part of Pipeworx — an MCP gateway connecting AI agents to 1394+ live data sources.

Tools

Tool Description
search_studies Search EBI BioStudies — a keyless database of biological study descriptions that links across EBI archives (ArrayExpress, PRIDE, etc.). Find studies by keyword and get accession, title, authors, type, release date, and link/file counts.
get_study Get the metadata for a single EBI BioStudies study by accession (e.g. "S-EPMC6010251"). Returns the title, flattened attributes (abstract, release date, data source, etc.), and counts of links and subsections. EBI BioStudies links across EBI archives. Keyless.

Quick Start

Add to your MCP client (Claude Desktop, Cursor, Windsurf, etc.):

{
  "mcpServers": {
    "biostudies": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/biostudies/mcp"
    }
  }
}

Or connect to the full Pipeworx gateway for access to all 1394+ data sources:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

Using with ask_pipeworx

Instead of calling tools directly, you can ask questions in plain English:

ask_pipeworx({ question: "your question about Biostudies data" })

The gateway picks the right tool and fills the arguments automatically.

More

License

MIT

from github.com/pipeworx-io/mcp-biostudies

Установить EBI BioStudies в Claude Desktop, Claude Code, Cursor

Рекомендуется · одна команда, все IDE
unyly install ebi-biostudies

Ставит в Claude Desktop, Claude Code, Cursor и VS Code — сам разбирается с npx, uvx и сборкой из исходников.

Впервые? Поставь CLI: curl -fsSL https://unyly.org/install | sh

Или настроить вручную

Выполни в терминале:

claude mcp add ebi-biostudies -- npx -y @pipeworx/mcp-biostudies

Пошаговые гайды: как установить EBI BioStudies

FAQ

EBI BioStudies MCP бесплатный?

Да, EBI BioStudies MCP бесплатный — установка в пару кликов через Unyly без оплаты.

Нужен ли API-ключ для EBI BioStudies?

Нет, EBI BioStudies работает без API-ключей и переменных окружения.

EBI BioStudies — hosted или self-hosted?

Self-hosted: сервер запускается локально на твоей машине командой из раздела установки.

Как установить EBI BioStudies в Claude Desktop, Claude Code или Cursor?

Открой EBI BioStudies на unyly.org, выбери вкладку своего клиента (Claude Desktop, Claude Code, Cursor) и нажми Install — конфиг сгенерируется автоматически, без правки JSON.

Похожие MCP

Compare EBI BioStudies with

Не уверен что выбрать?

Найди свой стек за 60 секунд

Автор?

Embed-бейдж для README

Похожее

Все в категории data