Command Palette

Search for a command to run...

UnylyUnyly
Весь каталог

Ncbi Eutils

БесплатноНе проверен

NCBI E-utilities — federated Entrez search/fetch (PubMed/Gene/Nucleotide/…)

GitHubEmbed

Описание

NCBI E-utilities — federated Entrez search/fetch (PubMed/Gene/Nucleotide/…)

README

NCBI E-utilities MCP — federated search and fetch across all NCBI Entrez databases: PubMed, Gene, Nucleotide, Protein, Taxonomy, ClinVar, dbSNP, OMIM, BioProject, BioSample, SRA, … Keyless (3 req/s without key).

Part of Pipeworx — an MCP gateway connecting AI agents to 1394+ live data sources.

Tools

  • einfo(db?) — database info / field list
  • esearch(db, term, retmax?, retstart?, sort?) — search → uid list
  • esummary(db, ids, retstart?) — summary records by uid
  • efetch(db, ids, rettype?, retmode?) — full records
  • elink(dbfrom, dbto, ids, linkname?) — links across databases
  • egquery(term) — global query across all databases

Data source

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/

Quick Start

Add to your MCP client (Claude Desktop, Cursor, Windsurf, etc.):

{
  "mcpServers": {
    "ncbi-eutils": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/ncbi-eutils/mcp"
    }
  }
}

Or connect to the full Pipeworx gateway for access to all 1394+ data sources:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

Using with ask_pipeworx

Instead of calling tools directly, you can ask questions in plain English:

ask_pipeworx({ question: "your question about Ncbi Eutils data" })

The gateway picks the right tool and fills the arguments automatically.

More

License

MIT

from github.com/pipeworx-io/mcp-ncbi-eutils

Установка Ncbi Eutils

У этого сервера нет опубликованного пакета — он собирается из исходников. Открой репозиторий и следуй инструкции в README.

▸ github.com/pipeworx-io/mcp-ncbi-eutils

FAQ

Ncbi Eutils MCP бесплатный?

Да, Ncbi Eutils MCP бесплатный — установка в пару кликов через Unyly без оплаты.

Нужен ли API-ключ для Ncbi Eutils?

Нет, Ncbi Eutils работает без API-ключей и переменных окружения.

Ncbi Eutils — hosted или self-hosted?

Self-hosted: сервер запускается локально на твоей машине командой из раздела установки.

Как установить Ncbi Eutils в Claude Desktop, Claude Code или Cursor?

Открой Ncbi Eutils на unyly.org, выбери вкладку своего клиента (Claude Desktop, Claude Code, Cursor) и нажми Install — конфиг сгенерируется автоматически, без правки JSON.

Похожие MCP

Compare Ncbi Eutils with

Не уверен что выбрать?

Найди свой стек за 60 секунд

Автор?

Embed-бейдж для README

Похожее

Все в категории development