Alphafold

БесплатноНе проверен

Provides access to AlphaFold predicted protein 3D structures from EBI, enabling retrieval of prediction metadata, summaries, annotations, and UniProt data.

автор: pipeworx-io

GitHub Embed

Описание

Provides access to AlphaFold predicted protein 3D structures from EBI, enabling retrieval of prediction metadata, summaries, annotations, and UniProt data.

README

EBI AlphaFold Protein Structure Database MCP — predicted 3-D protein structures for ~214 M sequences. Keyless.

Part of Pipeworx — an MCP gateway connecting AI agents to 1394+ live data sources.

Tools

prediction(qualifier) — full prediction metadata + file URLs (PDB, CIF, PAE)
summary(qualifier) — short structure summary
annotations(qualifier, type?) — sequence-level annotations (regions of low pLDDT, etc)
uniprot(uniprot_id) — same as prediction but explicit UniProt accession

qualifier is a UniProt accession (e.g. P00533).

Data source

https://alphafold.ebi.ac.uk/api/

Quick Start

Add to your MCP client (Claude Desktop, Cursor, Windsurf, etc.):

{
  "mcpServers": {
    "alphafold": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/alphafold/mcp"
    }
  }
}

Or connect to the full Pipeworx gateway for access to all 1394+ data sources:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

Using with ask_pipeworx

Instead of calling tools directly, you can ask questions in plain English:

ask_pipeworx({ question: "your question about Alphafold data" })

The gateway picks the right tool and fills the arguments automatically.

License

MIT

from github.com/pipeworx-io/mcp-alphafold

Установка Alphafold

У этого сервера нет опубликованного пакета — он собирается из исходников. Открой репозиторий и следуй инструкции в README.

▸ github.com/pipeworx-io/mcp-alphafold

FAQ

Alphafold MCP бесплатный?

Да, Alphafold MCP бесплатный — установка в пару кликов через Unyly без оплаты.

Нужен ли API-ключ для Alphafold?

Нет, Alphafold работает без API-ключей и переменных окружения.

Alphafold — hosted или self-hosted?

Доступен hosted-вариант: Unyly запускает сервер в облаке, локальная установка не обязательна.

Как установить Alphafold в Claude Desktop, Claude Code или Cursor?

Открой Alphafold на unyly.org, выбери вкладку своего клиента (Claude Desktop, Claude Code, Cursor) и нажми Install — конфиг сгенерируется автоматически, без правки JSON.